Børn bliver ikke født med blå øjne, da øjets pigment først dannes i løbet af det første år. Indtil da er iris næsten gennemsigtig, og det betyder, at øjenfarven bliver bestemt af bindevævet og de øvrige celler, der ligger under iris og giver den en blå farve.
Det er grunden til, at de fleste børn fødes med blå eller meget lyse øjne. Øjenfarven kommer fra pigmentet melanin i øjets iris, og mængden og typen af pigmenter, som dannes, er bestemt af generne.
Tre gener sørger for at danne en grøn, en brun og en blå udgave af melanin, mens andre gener regulerer mængden af pigment, og hvor det lægger sig i iris. Derfor er det meget svært at forudsige et barns øjenfarve.